Se puede llegar a la parte turística de Mykonos en autobús. La parada se encuentra justo a la salida del edificio de la terminal, pero los autobuses que salen del aeropuerto son intermitentes.
Si piensa alquilar un coche justo en el aeropuerto, debe tomar la carretera Επαρ.Οδ. Μυκόνου (la distancia es de unos 4 km). El aeropuerto de Mykonos cuenta con terminales de Avis (tel: +30-22-890-24-171), Hertz (tel: +30-22-890-22-890-22-890), Sixtie, Meridien Tours (tel: +30-22-890-23-173).
Pero lo mejor es utilizar los servicios de taxi: el aparcamiento se encuentra a la salida de la terminal. El precio de un taxi del aeropuerto al centro es de 6 EUR.