La temporada de baño en la ciudad puede inaugurarse en mayo: en esta época la temperatura del agua del mar Egeo alcanza los +20°C. De junio a septiembre, la temperatura del mar en Heraklion oscila entre +24 y +27°C, y la temporada de baño termina a principios de noviembre (aunque las frecuentes lluvias pueden estropear la temporada de baño).
Tenga en cuenta que la costa norte de Creta es muy ventosa, por lo que las olas del mar Egeo suelen levantarse dentro de Heraklion. Por la misma razón, mucha gente no recomienda pasar aquí las vacaciones con niños pequeños; es mejor ir a las afueras de la ciudad, por ejemplo, a la tranquila bahía de Agia Pelagia (a unos 25 kilómetros de Heraklion). En Heraklion, sin embargo, las mareas son prácticamente inexistentes y la entrada al mar es suave en todas las playas.
