El clima de Puerto de la Cruz permite realizar diversas actividades acuáticas. Los surfistas se congregan en Playa Martianez, una playa natural donde predominan las enormes olas del océano Atlántico. Pero las principales escuelas de surf se encuentran a lo largo de toda la costa. Las críticas más positivas las recogen la Escuela Atlantik Surf Tenerife y La Marea Surf School. Ofrecen alquiler de todo el equipo necesario. Los instructores trabajan tanto con adultos como con jóvenes surfistas.
También hay dos escuelas de buceo en la ciudad. Teide Divers no sólo ofrece clases de buceo, sino también excursiones al volcán Teide, el punto más alto de España. La segunda escuela, Dive Center ATLANTIK, recibe críticas muy controvertidas de los turistas y se centra exclusivamente en el buceo. Pero los restos de naufragios y los paisajes volcánicos submarinos eclipsan las asperezas del servicio.
El wakeboard, el wakesurf, el esquí acuático y el parasailing no son tan populares en el complejo. Sin embargo, se puede practicar parapente. Se ofrecen juegos y actividades acuáticas más relajados en todas las playas de la ciudad, sobre todo en el Lago Martianez, construido por el hombre. También se organizan excursiones en barco y catamarán con pesca.