El litoral de Chania está bañado por el mar de Creta, que forma parte de la cuenca mediterránea. Atrae a turistas de todo el mundo por sus aguas cristalinas y la belleza de sus numerosas bahías. En temporada alta la temperatura del mar de Creta es de +23°C, la del mar de Libia - una media de +25°C. En julio-agosto, la temperatura de los mares cretense y libio alcanza los +27°C.
Las mareas y marejadas son prácticamente inexistentes. Sin embargo, el mar cretense tiene un carácter voluntarioso. Puede agitarse de repente y volver a calmarse al cabo de un rato. Esto se debe a menudo a los vientos dominantes en la costa de Chania. En verano, pueden levantar olas bastante altas en los mares cretense y libio.