El clima mediterráneo continental de Portugal aporta calidez a las regiones meridionales, incluida Alvor. La primavera y el otoño en Alvor suelen ser más húmedos que los meses de verano, lo que atrae a los aficionados al golf.
Los inviernos en Alvor son testigos de un descenso de las temperaturas, que se sitúan en torno a los 12-18°C. Enero es el mes más frío, con temperaturas en torno a los +12°C. Las mayores precipitaciones en Alvor suelen producirse en diciembre, debido a las tormentas atlánticas y a los impredecibles patrones meteorológicos.
El complejo turístico de Alvor está situado en la desembocadura del río del mismo nombre, abarcando una extensa zona de 1.700 hectáreas caracterizada por bosques, espadaña, tierras de cultivo, dunas grises y arenosas, marismas y "calderas" de sal. El estuario del Alvor forma parte integrante de la red europea de espacios naturales Natura-2000, y sus lagunas costeras son ricas en flora y fauna diversas.
