Como en todos los centros turísticos griegos, el transporte en Agios Nikolaos funciona puntualmente y es bastante asequible. Por ejemplo, un viaje desde el centro de la ciudad a varios distritos suele costar alrededor de 1,5 EUR. Los viajes más largos entre ciudades y complejos turísticos pueden costar algo más, aproximadamente entre 5 y 7 euros. En la estación de autobuses de Agios Nikolaos podrá obtener fácilmente un folleto gratuito con los horarios de los autobuses.
Para aquellos que busquen consejos sobre el transporte en Agios Nikolaos, los viajeros experimentados aconsejan tener precaución en las carreteras debido a una tasa de accidentes relativamente alta. Esto suele atribuirse a los impulsivos hábitos de conducción de los griegos y al terreno montañoso de la localidad.